Cuando sé es ganador, en la primera plana siempre sale el técnico, es el hombre principal, es el entrenador quien se se lleva la portada de los principales medios, sin a veces imaginar que detrás de todo éxito hay personas que trabajan en silencio, es el caso de Javier Núñez, quien se ha convertido en el arquitecto de la transformación de Motagua en los últimos años bajo el mando de Diego Vásquez.
La buena relación que Diego y Núñez han tenido desde años anteriores, valió para ser contratado por Motagua, una vez que el argentino se hizo cargo del club, Javier ya tenía experiencia, antes había estado vinculado con el desaparecido Pumas UNAH, luego se fue abriendo camino en clubes de la Segunda División, hasta convertirse en el asistente del fallecido Edwin Pavón, mientras ambos estuvieron dirigiendo al Hispano de Comayagua en la temporada del 2007.
Lo que dice Javier Núñez en el equipo es tomado en cuenta por el entrenador, muchos tienen cuidado hasta para hablar cuando él está cerca.
Una vez que Diego Vásquez fichó para Motagua, no esperó que pasará mucho tiempo para apostar por su hombre de confianza, su relación con Reinaldo Clavasquin, técnico del equipo reservas no era la mejor, estaba deteriorada, incluso, no se dirigían las palabras y decidió poner en su lugar a Javier Núñez, quién logró calzar en el equipo Motagua, ya que logró ganar un Torneo de Reservas con el club.
Fue en el 2016 que Javier Núñez llegó al equipo, y su trabajo ha sido todo un éxito, a pesar de tener inconvenientes con varios jugadores en el equipo, Núñez ha estado orquestando al lado de Diego Vásquez el éxito del equipo en los últimos años, el técnico catracho se encarga de pasar el informe de todo lo que pasa en el equipo al argentino, hace los análisis técnicos y tácticos de los equipos rivales, y también estudia el desempeño de los jugadores. Es una voz autorizada que escucha Vásquez.
Son tantos los logros de Javier Núñez en Motagua, que mientras estuvo dirigiendo en la categoría de reservas, sacó varios jugadores para el primer equipo como es el caso de Denil Maldonado, Jack Baptiste, Jonathan Núñez, Josué Villafranca y otros futbolistas que han logrado debutar con el equipo.
